Universit�� Clermont Auvergne_老虎机游戏

Enqu��te sur la Base De Connaissances_老虎机游戏

Melodie.BRUNNER@uca.fr (Melodie BRUNNER) — Sun, 14 Apr 2024 22:00:00 GMT

Ch��r��es ��tudiant��es, chers membres du personnel,

Qu��est-ce que la Base De Connaissance ?
Cette plateforme regroupe un ensemble de ressources num��riques tels que des tutoriels, des articles de d��pannage, ou encore des F.A.Q en lien avec l��Universit�� Clermont Auvergne et ses services.

Vous pouvez facilement la retrouver sur votre espace ENT (Cf. GIF)

Que vous soyez un utilisateur r��gulier ou occasionnel, votre feedback contribuera �� am��liorer son utilisation.

R��pondre �� cette enqu��te ne vous prendra que quelques minutes.
Les questions sont con?ues pour ��tre simples et directes, et votre anonymat sera pr��serv��.
?

Cliquez ici pour acc��der �� l'enqu��te :

https://forms.office.com/e/2U7V5Yy9PD

Nous vous remercions par avance pour le temps que vous prendrez pour r��pondre �� nos questions.

Bien cordialement,
L��?quipe du Centre De Service

Journ��e "Cycle de vie des donn��es en Biologie"_老虎机游戏

Nadia.GOUE@uca.fr (Nadia GOUE) — Mon, 01 Apr 2024 22:00:00 GMT

La plateforme AuBi est invit��e �� pr��senter ses activit��s sous le focus Science Ouverte et FAIRification �� la Journ��e "Cycle de vie des donn��es en Biologie"
Toutes les informations sont disponibles sur le site sciencesconf.org

?/ 1

Avec Teams, profitez d'un outil de communication collaboratif !_老虎机游戏

Camille.AUBE@uca.fr (Camille AUBE) — Sun, 17 Mar 2024 23:00:00 GMT

Organisez des visioconf��rences

Microsoft Teams vous permet de dialoguer rapidement sur votre ordinateur, tablette ou smartphone. Cette solution centralise et facilite les ��changes par des conversations en temps r��el. Celles-ci peuvent se faire par messages instantan��s ou diff��r��s, par conf��rences vid��o ou audio pour vos classes virtuelles ou des webinaires. Mais elle offre encore bien d'autres possibilit��s :
?

Collaborez en ��quipe et cr��ez des conversations

Microsoft Teams est une application de collaboration con?ue pour le travail hybride : il est possible de cr��er et g��rer des ��quipes entre coll��gues ou ��l��ves. Ces ��quipes permettent de faciliter la communication �� travers des canaux de conversations, la cr��ation de r��union d'��quipes et le partage de nombreux fichiers.
?

Planifiez & participez �� des r��unions

Partagez vos ��crans & fichiers

Lors de vos r��unions et de vos ��changes, vous avez la possibilit�� de partager directement votre ��cran avec vos interlocuteurs. Le partage d��cran est utile car il vous aide �� collaborer efficacement, et am��liorer la compr��hension pendant vos r��unions.Par exemple, vous pouvez organiser une r��union pour discuter de propositions de modification d��un document.

?

L'outil est adapt�� la plupart des ��changes du quotidien, hors sensibilit�� des donn��es ou ��changes particuli��re. La DOSI reste disponible pour vous apporter tout conseil de vigilance lors du partage de donn��es sensibles, requis quel que soit l'outil de travail en ��quipe, ou de messagerie instantan��e utilis��.

Consultez la note de service sur les outils num��riques de l��UCA et les donn��es sensibles.

Lancement du service STORM_老虎机游戏

Camille.AUBE@uca.fr (Camille AUBE) — Thu, 07 Mar 2024 23:00:00 GMT

Pr��sentation du service :

STORM est le service de stockage s��curis�� des donn��es de recherche de l��UCA mis en place par la DOSI.

Les laboratoires de l��UCA ne disposaient pas tous de solutions fiables et s��curis��es pour stocker leurs donn��es de mani��re p��renne, entra?nant un risque pour la viabilit�� et la s��curit�� de leurs donn��es. Le p?le Appui �� la Recherche & M��socentre a d��velopp�� une solution pour r��pondre �� cette probl��matique : Le projet STORM (STOckage Recherche M��socentre) fournit maintenant un stockage fiable aux laboratoires de l��UCA, accessible en mode fichier.c
?

Composition du service :

STORM est compos��?:

D��un espace de stockage d��di�� au laboratoire
D��une application?Web de gestion des contr?les d��acc��s

Tutoriel :

Comment faire une demande d'acc��s �� STORM ?

3 outils indispendables pour modifier un fichier PDF_老虎机游戏

Camille.AUBE@uca.fr (Camille AUBE) — Mon, 12 Feb 2024 23:00:00 GMT

Que vous soyez personnels ou enseignants/chercheurs, ces fonctionnalit��s am��liorent significativement votre productivit�� et simplifient vos t?ches quotidiennes. Cette liste de fonctionnalit��s vise �� faciliter votre travail quotidien, que ce soit pour vos t?ches quotidiennes, la recherche ou l'administration.

Ceci est un exercice d'hame?onnage !_老虎机游戏

Camille.AUBE@uca.fr (Camille AUBE) — Tue, 23 Jan 2024 23:00:00 GMT

Newsletter interne de la DOSI - Evolution n��17_老虎机游戏

Camille.AUBE@uca.fr (Camille AUBE) — Wed, 17 Jan 2024 23:00:00 GMT

Actualit�� de la DOSI

Bienvenue aux nouveaux arrivants !

La Direction Op��rationnelle des Syst��mes d'Information a le plaisir d'accueillir :

au sein p?le M��socentre, B��r��nice Batut pour la plateforme AuBI (Auvergne BioInformatique)
au sein du p?le Service Num��rique, Damien Gros en tant que d��veloppeur

Livret d'accueil de l'agent DOSI

Pour faciliter l��int��gration d��un nouvel arrivant, un livret d��accueil est mis �� disposition sur l��intranet de l��UCA.

Ce livret d��accueil est un document num��rique qui permettra �� tout le monde et notamment aux nouveaux arrivants de s��impr��gner du service mais ��galement de se familiariser rapidement avec les proc��dures et pratiques mises en place.
Cliquez sur le lien suivant pour consulter le livret.

?

Actualit�� des Services

Modernisation cluster VMWare de virtualisation

Les nouveaux hyperviseurs HPE sont d��sormais en production, menant �� une modernisation et une densification de l'infrastructure de virtualisation.
En effet, les nouveaux serveurs poss��dent 64 coeurs/128 threads et 1To de RAM, permettant d'accueillir davantage de machines virtuelles par serveur, et entra?nant donc une meilleure efficacit�� nerg��tique et moins d'espace occup�� dans le datacenter.

Migration de la messagerie Zimbra 9

L'infrastructure de messagerie a ��volu�� vers la version 9 de Zimbra, et certaines parties techniques ont ��t�� mieux int��gr��es dans le socle commun du p?le infrastructures syst��me.
Le client web de la messagerie a suivi cette ��volution et propose d��sormais une interface plus r��active et adaptative, offrant un meilleur confort sur les terminaux mobiles. Les migrations continuent afin de poursuivre la r��installation en RedHat des plus de 150 serveurs encore restants �� traiter avant juin 2024.

?

MyBookings : nouvel outil de r��servation

Le d��veloppement de l��outil qui vous a ��t�� pr��sent�� au DSIDay 2023 au mois de juin et qui remplacera GRR entrera en phase de test dans les locaux de Turing �� la fin du mois de janvier. Une premi��re phase de d��ploiement est pr��vue ensuite au PME et devra permettre aux ��tudiants de r��server les box de travail en toute autonomie. MyBookings ��tant li�� au contr?le d��acc��s de ces salles, les ��tudiants seront donc accr��dit��s de l'acc��s �� ces box de travail �� la demande. Une deuxi��me phase de d��ploiement de l��outil aura pour objectif les box du travail du KAP (Learning Center) au mois de septembre.

Compte rendu de l'atelier sur la Cellule Alex

La cellule Alex est un dispositif qui accompagne et ��coute les personnes t��moins ou victimes d��acte de violence sexiste, sexuelle ou discriminatoire. Pour pr��senter ce dispositif, un atelier de pr��sentation a ��t�� organis�� au sein de la DOSI le 21 d��cembre 2023.
?
Cet atelier a permis de r��unir une dizaine de personne en moyenne. Certaines ont t��moign�� de leurs exp��riences et ont fait part de leurs remarques et de leurs interrogations sur le fonctionnement de la cellule Alex et sur l'accompagnement de la personne victime de discriminations et/ou de violences sexistes et sexuelles.
?
Pour donner suite �� cet atelier, les id��es et remarques ont ��t�� remont��es au comit�� galit�� et un prochain atelier aura lieu courant l��ann��e 2024.

Newsletter interne de la DOSI - Evolution n��16_老虎机游戏

Camille.AUBE@uca.fr (Camille AUBE) — Wed, 10 Jan 2024 23:00:00 GMT

Actualit�� de la DOSI

Bienvenue aux nouveaux arrivants !

La Direction Op��rationnelle des Syst��mes d'Information a le plaisir d'accueillir :

au sein de la cellule S��curit��, Cl��ment Oziol en tant qu'administrateur syst��mes et r��seaux;
au sein du p?le Service Num��rique, Lucas Zborowski en tant que d��veloppeur;
au sein de la cellule Caplab, Maxime Daumur en tant que d��veloppeur;
au sein du p?le Proximit��, Thibaut Zapata en tant que technicien.

Livret d'accueil de l'agent DOSI

Pour faciliter l��int��gration d��un nouvel arrivant, un livret d��accueil est mis �� disposition sur l��intranet de l��UCA.

Ce livret d��accueil est un document num��rique qui permettra �� tout le monde et notamment au nouveaux arrivants de s��impr��gner du service mais ��galement de se familiariser rapidement avec les proc��dures et pratiques mises en place.
Cliquez sur le lien suivant pour consulter le livret.

?

Actualit�� des Services

Fiche Immobilisation

Une nouvelle version de l��outil ? Fiche immo DBF ? vient d��tre mise en ligne. Cet outil permet aux gestionnaires financiers d��obtenir toutes les informations n��cessaires pour cr��er la fiche immo dans SIFAC (num��ro d��inventaire, num��ro de s��rie, localisation, date de mise en service).
Le point d��entr��e pour les gestionnaires est le num��ro de commande SIFAC.

Le nouveau d��veloppement interroge maintenant les deux bases utilis��es par les ��quipes de la DOSI, la base GESPI et la base NetBox.

L��application est accessible �� l��adresse suivante :?https://dbf-fiche-immo.uca.fr/?ou via la page?https://ent.uca.fr/core/amsi

Nouveau menu et tableau de bord de l'ENT

La refonte du nouveau menu s'int��gre dans le nouveau design du site universitaire uca.fr.?
Ce nouveau menu, plus ergonomique et orient�� mobile, comporte un bloc commun �� tous selon votre profil et un acc��s rapide vers vos outils et services les plus utilis��s (lors des 3 derniers mois).

Une nouvelle cat��gorisation simplifi��e des liens vous aidera �� vous orienter plus facilement pour acc��der aux applications de l'UCA.
?

Pour rester en coh��rence avec le nouveau menu, une refonte graphique de la page d'accueil de l'ENT a ��t�� r��alis��e.

Tout en gardant le concept de "widget", ce nouveau tableau de bord sera compos�� d'une partie email, d'un agenda regroupant le calendrier zimbra et l'emploi du temps ADE et des raccourcis boutons vers vos outils et services selon votre profil. Sa mise en place est programm��e �� partir du 6 novembre.

Point consommation carbone

Pour 2023, une estimation de notre consommation s'��l��ve �� 1 480 000 kWh uniquement avec la salle serveur de Turing. Pour l'ensemble du b?timent (DC, salle serveur, salles r��seaux), l'estimation de la consommation s'��l��ve quant �� elle �� 1 700 00 kWh.

La consommation moyenne par rack (armoire de serveur) est en moyenne de 3.2 kW. En se basant sur le chiffre retenue par l'ADEME pour le co?t carbone du kWh en France m��tropolitaine (= 1kwh = 52g eq. CO?), la salle serveur repr��sente 77 tonnes de CO? pour 2023 (soit l'��quivalent de 300 000 km en voiture).

Concernant le m��socentre, on estime que l'on consomme 37% des kWh de la salle serveur soit environ 500 000 khW (26 tonnes de CO? sur l'ann��e). Par heure, cela fait 0,9 g de CO? consomm��e par les utilisateurs du m��socentre.

#9 S��curit�� Num��rique_老虎机游戏

Camille.AUBE@uca.fr (Camille AUBE) — Wed, 29 Nov 2023 23:00:00 GMT

Nous sommes tous concern��s, chacun dans son domaine, les personnels BIATSS, les enseignants-chercheurs tout autant que les ��tudiants.
La menace est polymorphe, sans cesse changeante et usurpe la plupart du temps des identit��s institutionnelles pour vous pi��ger. Le niveau de risque est actuellement ��lev��.
?

Nous vous rappelons ici les gestes d'hygi��ne informatique ��l��mentaire :

Identifier les mails frauduleux et adopter la bonne conduite �� tenir : https://confluence.dsi.uca.fr/pages/viewpage.action?pageId=98804087

Identifier les sites frauduleux qui usurpent la charte officielle de l'UCA : https://confluence.dsi.uca.fr/pages/viewpage.action?pageId=98798553

G��rer son compte informatique et ses mots de passe de mani��re s��curis��e : https://confluence.dsi.uca.fr/pages/viewpage.action?pageId=76547010

D��s lors qu'une des mesures ci-apr��s n'aurait pu ��tre respect��e :

Signalez la tentative de fraude aupr��s des ��quipes informatiques, et proc��dez en urgence au changement de votre mot de passe pour prot��ger votre compte et l'organisation dans son ensemble.

L'Universit�� pourra proc��der ponctuellement �� des simulations sur les boites mails UCA. Nous comptons sur la vigilance de chacun.?

Journ��e AuBi Bioinfo 2023_老虎机游戏

Nadia.GOUE@uca.fr (Nadia GOUE) — Tue, 28 Nov 2023 23:00:00 GMT

La plateforme AuBi et les ��tudiants du Master 1 Bioinformatique vous propose une journ��e d'animation le mercredi 06 D��cembre 2023 intitul��e

Structuration de la bioinformatique et prospectives �� 5 ans

sur le site clermontois

Programme de la journ��e

Matin

8h30-9h00 : Accueil des participants

9h00-9h10 : Ouverture et Introduction.

Pierre Peyret, MEDIS et Resp. Scientifique AuBi

Nadia Gou��, M��socentre Clermont-Auvergne, Resp. Op��rationnelle et co-Resp. Technique AuBi

Session 1 - G��nomique & transcriptomique

9h10 - 9h30 : Pr��diction de pathologies humaines �� travers le d��veloppement de r��seaux de neurones profonds bas��s sur une description des microbiotes au niveau de l'esp��ce. Sophie Marre, MEDIS ; Mots-cl��s : pathologies humaines, microbiotes, ADNr 16S, intelligence artificielle, r��seaux de neurones

9h30 - 9h50 : Bioinformatique et G��nomique chez les c��r��ales. H��l��ne Rimbert, Pauline Lasserre-Zuber et Fr��d��ric Choulet, GDEC ; Mots-cl��s : g��nomique, s��quen?age, annotation, pang��nomique, graphes

9h50 - 10h10 : Bioinformatique �� l'ICCF: du traitement de donn��es NGS �� la mod��lisation mol��culaire. Pierre Amato, ICCF ; Mots-cl��s : NGS, mod��lisation mol��culaire, imagerie, activit�� enzymatique, thermodynamique

10h10 - 10h30 : PHROG : Cr��ation de familles de prot��ines de virus et interface Web. Fran?ois Enault, LMGE ; Mots-cl��s : familles de prot��ines, clustering, homologie lointaine, virus, annotation, Web

10h30 - 10h40 : debriefing Session 1 sur nos approches omiques

10h40 -11h10 : Pause

Session 2 - Science ouverte

11h10 - 11h30 : Infrastructure de Stockage et Science Ouverte : un mariage n��cessaire ! Antoine Mahul, Nadia Gou��, M��socentre & Plateforme AuBi ; Mots-cl��s : M��socentre, service, science ouverte, stockage, donn��es

11h30 - 11h50 : OMERO comme solution pour visualiser, stocker, organiser et analyser les grands jeux de donn��es d'images. Sophie Desset, iGReD ; Mots-cl��s : image, stockage, OMERO, FAIR, plan de gestion des donn��es

11h50 - 12h00 : debriefing Session 2 sur nos approches de Science Ouverte

Apr��s-midi

Session 3 - Prot��omique & m��tabolomique

13h30 - 13h50 : Nutrition humaine, sant�� et Bioinformatique. Franck Giacomoni, UNH ; Mots-cl��s : M��tabolomique, Big Data, Syst��mes d��information, Galaxy

13h50 - 14h20 : Workflow d��analyses sur la composante prot��omique et perspective. Thierry Sayd, QuaPA ; Mots-cl��s : prot��omique, spectres de masses, traitement du signal, base de donn��es, statistiques

14h20 - 14h30 : debriefing Session 3 sur nos approches omiques

Session 4 - Imagerie & Microscopie

14h30 - 14h50 : Segmentation 3D �� haut d��bit des images par Biom3D, un nouvel outil modulable bas�� sur l'apprentissage profond. Fr��d��ric Chausse, Institut Pascal ; Mots-cl��s : deep-learning, analyse d��image, traitement du signal

14h50 - 15h10 : High content imaging analysis integration in Galaxy. Pierre Osteil, iGReD ; Mots-cl��s : Development, Embryonic stem cell, pseudo-embryo, Hippo, Automated microscopy

15h10 - 15h30 : Traitement automatis�� d'images d'OMERO dans ImageJ. Pierre Pouchin, iGReD ; Mots-cl��s : OMERO, ImageJ, traitement d'images, workflow, FAIR

15h30 - 15h40 : debriefing Session 4 sur nos approches de stockage, d��analyse et de publication

Table Ronde

15h40-17h00 : Table Ronde et Discussions

15h40 - 16h : R��flexions prospectives pour le LMGE. Gis��le Bronner, LMGE ; Mots-cl��s : machine learning, g��nomique, Microorganismes, imagerie, int��gration de donn��es

D��finition des mots-clefs AuBi et des principaux axes de recherche.
Faut-il cr��er de nouveaux axes th��matiques ou au contraire fusionner des axes?
Quelles sont les futures attentes scientifiques?

Comit�� d'organisation
Gis��le Bronner, UCA - LMGE
Nadia Gou��, UCA - M��socentre Clermont-Auvergne - AuBi
Yoan Renaud, CNRS - iGReD
H��l��ne Rimbert, INRAE - GDEC
Christophe Tatout, UCA - iGReD, Responsable du Master Bioinformatique

#9 S��curit�� Num��rique_老虎机游戏

Camille.AUBE@uca.fr (Camille AUBE) — Wed, 22 Nov 2023 23:00:00 GMT

Nous vous rappelons ici les gestes d'hygi��ne informatique ��l��mentaire :

Identifier les mails frauduleux et adopter la bonne conduite �� tenir
https://confluence.dsi.uca.fr/pages/viewpage.action?pageId=98804087

Identifier les sites frauduleux qui usurpent la charte officielle de l'UCA
https://confluence.dsi.uca.fr/pages/viewpage.action?pageId=98798553

G��rer son compte informatique et ses mots de passe de mani��re s��curis��e
https://confluence.dsi.uca.fr/pages/viewpage.action?pageId=76547010

?

D��s lors qu'une des mesures ci-apr��s n'aurait pu ��tre respect��e :

Venez participer au Trivial Pursuit UCA pour les ��tudiants !_老虎机游戏

Melodie.BRUNNER@uca.fr (Melodie BRUNNER) — Sun, 08 Oct 2023 22:00:00 GMT

Rendez-vous le 16 octobre 2023, de 13 h �� 14 h en salle 247 �� l��cole de Droit !

Vous participerez �� l��un des ateliers ludiques organis��s par le Centre de Service, en collaboration avec les Biblioth��ques Universitaires ! Dans celui-ci, vous retrouverez un plateau quasi-similaire �� celui d��un Trivial Pursuit avec uniquement des questions sur votre vie d��tudiant.e �� l��UCA.

Par exemple :

Est-ce que je dois m'inscrire �� la B.U ?
O�� puis-je trouver mon relev�� de notes ?
Qu'est-ce qu'une U.E Libre ?
Comment savoir si mon compte Office 365 est bien activ�� ?

En cas de bonnes r��ponses, vous compl��tez petit �� petit votre camembert. Une fois complet, vous gagnez la meilleure r��compense parmi les goodies disponibles ! Pour tous les autres participants, des cadeaux sont ��galement �� gagner !

Attention, le nombre de place est limit��, vous pouvez venir le jour m��me ou r��server d��s maintenant en envoyant un mail �� l��adresse suivante : support@uca.fr !

Bonne journ��e et bonne d��couverte !

Vous rencontrez un probl��me ? Vous avez une question ?_老虎机游戏

Herve.DANO@uca.fr (Herve DANO) — Wed, 20 Sep 2023 22:00:00 GMT

Vous retrouverez ci-dessous les permanences tenus par les Assistants de Proximit�� Universitaires dans les biblioth��ques Universitaires de l'UCA.
?

Permanences du Centre De Service

Pour plus de pr��cision sur les Guichets

Pour en savoir plus sur le Centre De service cliquez ici

Conf��rence AuBi �� la Journ��e AUDACES_老虎机游戏

Nadia.GOUE@uca.fr (Nadia GOUE) — Tue, 30 May 2023 22:00:00 GMT

La plateforme AuBi collabore avec l'IGBMC (plateforme BIGEST), toutes deux membres de l'Institut Fran?ais de Bioinformatique pour proposer un tableau de bord permettant la gestion des projets de recherche r��pondant "au mieux" aux principes FAIR (Facie �� trouver, Accessible, Interop��rable, R��-utilisable) de la Science Ouverte.
L'IGBMC a initi�� le projet en 2019 et AuBi a rejoint l'aventure en 2022 gr?ce �� un financement de la Cellule Science Ouverte de l'UCA.

?/ 1

Journ��e AuBi Science Ouverte_老虎机游戏

Nadia.GOUE@uca.fr (Nadia GOUE) — Tue, 17 Jan 2023 23:00:00 GMT

14h - 15h15 : "Science Ouverte et reproductible : ��l��ments de contexte et pistes de mise en ?uvre" par Fr��d��ric de Lamotte, R��f��rent Donn��e (INRAE Montpellier)

Il sera question de reproductibilit�� scientifique, de principes FAIR, de m��ta-donn��es et p��rennisation des donn��es.

Ce s��minaire sera suivi d��une pr��sentation de l��outil OpenLink par les coll��gues de l��Universit�� de Strasbourg et de l'IFB.
?

15h30 - 17h00 :? "Pr��sentation et D��monstration de l'outil OpenLink" par Laurent Bouri, Julien Seiler (IGBMC Strasbourg et plateforme BiGEst), Mateo Hiriart et Nadia Gou�� (plateforme AuBi, M��socentre, UCA)

OpenLink est une application web con?ue pour fournir au chercheur une vue claire des donn��es associ��es �� chaque projet de recherche. Elle r��duit les obstacles �� l'adoption des principes FAIR et aide les chercheurs �� agr��ger leurs donn��es et leurs analyses produites par exemple dans OMERO ou Galaxy ainsi qu'�� publier leurs donn��es. L'application sera prochainement d��ploy��e sur la plateforme AuBi.

Pr��sentation Science Ouverte par Fr��d��ric De-Lamotte

?/ 1

?T��l��charger

Pr��sentation OpenLink par Laurent Bouri, Nadia Gou��, Mateo Hiriart, Julien Seiler

?/ 1

?T��l��charger

Journ��e d'animation AuBi GPU_老虎机游戏

Nadia.GOUE@uca.fr (Nadia GOUE) — Sun, 25 Dec 2022 23:00:00 GMT

L'acc��s est libre et gratuit. Cependant pour une question d'organisation, merci de vous inscrire en contactant le M��socentre Clermont-Auvergne ou la plateforme AuBi.

Multi-omics integration: A new tool for biologists_老虎机游戏

Nadia.GOUE@uca.fr (Nadia GOUE) — Wed, 30 Nov 2022 23:00:00 GMT

Cet atelier a pour but de pr��senter des outils et des techniques innovants pour l'int��gration des donn��es Omics.

Programme de la journ��e :

8h45 : Ouverture?

9.00 - 9.45 : Dr Kim-Anh Le Cao (Universit�� de Melbourne, Australie)

TimeOmics, for the integration of longitudinal data & Sincast, for the construction of an atlas of transcriptomic data.

9.45 - 10.30 : Dr Christophe Ambroise (Universit�� d'?vry Val d'Essonne, France)

Compression and interaction of omics variables for vertical data integration.

10.30 - 11.15 : Dr Mathe Ewy & Tara Eicher (Ohio State University, USA)

Exploring relationships between metabolites, genes, and proteins.

11.15 - 12.00 : Dr Romina Pedreschi (Universit�� Catolica de Valparaiso, Chili)

Sharing experiences in omics data integration in fruit postharvest biology.

L'apr��s-midi (13h30 - 16h00) sera consacr��e �� une discussion avec le public sur le domaine de recherche de l'int��gration des donn��es omiques.

Si vous souhaitez assister �� ce workshop en distanciel, merci de nous contacter directement sur l'adresse m��l aubi_at_uca.fr.

Journ��e AuBi Bioinfo-NGS 2022_老虎机游戏

Nadia.GOUE@uca.fr (Nadia GOUE) — Sun, 06 Nov 2022 23:00:00 GMT

La plateforme AuBi accompagne les ��tudiants du Master 1 Bioinformatique dans l'organisation d'une journ��e d'animation autour des NGS le mardi 06 D��cembre 2022.

Cette ann��e, nous aurons le plaisir d'accueillir 2 invit��s ext��rieurs :

Nils Stein, ��One genome, many genomes �C the pangenome of barley", IPK
Christophe Blanchet, "IFB Cloud and Digital Services for Life Sciences", CNRS Lyon

Programme de la journ��e
?

Matin

08:30 �C Accueil des participants
08:45 �C Pierre Peyret (MEDIS) : Pr��sentation de la plateforme Auvergne Bioinformatique (AuBi)
08:50 - Christophe Tatout (iGReD) : Pr��sentation du Master Bioinformatique de l'UCA
09:00 - H��l��ne Rimbert, Pauline Lasserre-Zuber : (GDEC, ��quipe Bioinfo) : pr��sentations courtes d'anciennes ��tudiantes de Master Bioinformatique
09:20 - C��cile Lep��re (LMGE) : Approches omiques pour d��chiffrer la diversit�� et le r?le fonctionnel des micro-organismes dans les ��cosyst��mes aquatiques
09:40 - Philippe Label (PIAF) : Mesure des pores d'aquaporines avec un workflow de dynamique mol��culaire sur la plateforme Galaxy de AuBi

10:00 - Pause Caf��
?

10:30 - Joris Mordier (iGReD) : ?tude de la fonction du variant d'histone H2A.B au cours de la spermatogen��se par Single-Cell RNA-seq
10:50 - Oshma Chakoory (MEDIS) : RIBOTAXA: les nouveaut��s r��v��l��es par des approches combin��es de m��tag��nomique pour la r��solution taxonomique jusqu'au niveau de l'esp��ce
11:10 - Nils Stein (IPK) : One genome, many genomes �C the pangenome of barley

Apr��s-midi

14:00 - Christophe Blanchet (IFB) : IFB Cloud et services num��riques pour les sciences de la vie
15:00 - David Grimbichler, Nadia Gou�� (M��socentre, AuBi) : Infrastructure du M��socentre et panorama des ressources et des activit��s de la plateforme AuBI

15:20 - Pause Caf��
?

15:50 - Lor��ne Belval (ANSES) : D��veloppement de la d��tection des parasites de plantes par s��quen?age �� haut-d��bit pour la station de quarantaine post-entr��e fran?aise
16:10 - Fr��d��ric Choulet (GDEC) : Aper?u des projets d��velopp��s au GDEC sur la g��nomique et la bioinformatique du bl��
16:30 - Pierre Marin (IFB, AuBi) : ABRomics, une plateforme num��rique sur la r��sistance antimicrobienne pour stocker, int��grer, analyser et partager des donn��es multi-omiques
16:50 - Conclusions

R��sum�� de la pr��sentation de Nils Stein :

?/ 1

R��sum�� de la pr��sentation de Christophe Blanchet :

?/ 1

Journ��e AuBi Bioinfo-NGS 2021_老虎机游戏

Nadia.GOUE@uca.fr (Nadia GOUE) — Sun, 14 Nov 2021 23:00:00 GMT

Programme :

Matin

09:30 �C Accueil des participants
09:40 �C Fr��d��ric Choulet et Nadia Gou�� : Pr��sentation du M��socentre Clermont Auvergne et de la plateforme AuBi
10:00 - V��ronique GAUTIER (GDEC, plateforme Gentyane) : S��quen?age long-read et cartographies optiques
10:20 - H��l��ne RIMBERT (GDEC, ��quipe Bioinfo) : Assemblage long-read du g��nome du bl�� tendre cv Renan
10:40 - Yoan RENAUD (iGReD) : S��quen?age long-reads pour l��assemblage et la d��tection de m��thylation ADN & utilisation Hi-C
11:10 - Sophie MARRE (MEDIS) : Revealing large microbial species diversity hidden behind 16S rRNA OTUs obtained from metabarcoding

11:30 - Pause Caf��

11:50 -?Alessandra CARBONE (Laboratoire de Biologie Computationnelle et Quantitative, Sorbonne Universit��) : Espace des s��quences, apprentissage profond et le probl��me de l'identification de partenaires prot��iques

Apr��s-midi

14:00 - Rapha?lle PEGUILHAN (ICCF) : D��veloppement d'un workflow pour l'analyse de donn��es m��tag��nomiques et m��tatranscriptomiques dans un contexte environnemental
14:20 - Cyrille SAINTENAC (GDEC, ��quipe MDC) : Capture d'exome des g��nes de r��sistance �� la Septoriose du bl�� tendre
14:40 -?Maxime BISSEUX (LMGE, ��quipe EPIE) : Monitoring des eaux us��es avec suivi de virus ent��ro par pacbio et Covid par illumina
15:00 - Mamadou DIA SOW (GDEC, ��quipe PaleoEvo) : Analyse de donn��es multi-omiques
15 :30 - Temps d'��change et conclusions

Webinaire "BigData pour l'int��gration de donn��es biologiques"_老虎机游戏

Nadia.GOUE@uca.fr (Nadia GOUE) — Mon, 17 May 2021 22:00:00 GMT

Programme :

13H45-14H30 : Marie-Laure Martin Magniette & Etienne Delannoy, Conserved stress response between Arabidopsis and yeast
14H30-15h15 : Tomas Schiex, Graphical Models for data integration in genomics and structural biology
15H15-16H00 : Christophe Ambroise, Discovering multi-scale metagenomic signatures through hierarchical organization of species
16H00-16H30 : S��bastien D��jean, Multilevel and vertical integration in MixOmics
16H30-17H00 : temps d'��change et conclusion